Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUSD5O60279 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms