Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DENRO43583 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DENRO43583 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DENRO43583 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DENRO43583 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DENRO43583 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms