Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BQF6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BQF6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BQF6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BQF6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BQF6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BQF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms