Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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