Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A0A0U1RRA0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms