Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARL11-201ENST00000282026 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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