RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.21□□□□□ -0.14
TRPS1-208ENST00000519076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.98□□□□□ -0.17
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.59□□□□□ -0.23
TRPS1-208ENST00000519076 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TRPS1-208ENST00000519076 MYT1Q01538 1121 aa13.41□□□□□ -0.26
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC9O60706 1549 aa13.31□□□□□ -0.28
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.99□□□□□ -0.33
TRPS1-208ENST00000519076 SCRIBQ14160 1630 aa12.99□□□□□ -0.33
TRPS1-208ENST00000519076 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TRPS1-208ENST00000519076 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-208ENST00000519076 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-208ENST00000519076 NACADO15069 1562 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-208ENST00000519076 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.78□□□□□ -0.36
TRPS1-208ENST00000519076 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-208ENST00000519076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM41Q8WV44 630 aa12.72□□□□□ -0.37
TRPS1-208ENST00000519076 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.7□□□□□ -0.38
TRPS1-208ENST00000519076 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TRPS1-208ENST00000519076 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.62□□□□□ -0.39
TRPS1-208ENST00000519076 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.61□□□□□ -0.39
TRPS1-208ENST00000519076 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.49□□□□□ -0.41
TRPS1-208ENST00000519076 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TRPS1-208ENST00000519076 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.44□□□□□ -0.42
TRPS1-208ENST00000519076 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TRPS1-208ENST00000519076 WIZO95785 1651 aa12.38□□□□□ -0.43
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.36□□□□□ -0.43
TRPS1-208ENST00000519076 SLC24A1O60721 1099 aa12.29□□□□□ -0.44
TRPS1-208ENST00000519076 HRCP23327 699 aa12.29□□□□□ -0.44
TRPS1-208ENST00000519076 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
TRPS1-208ENST00000519076 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TRPS1-208ENST00000519076 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCA4P51532 1647 aa12.24□□□□□ -0.45
TRPS1-208ENST00000519076 APLP2Q06481 763 aa12.24□□□□□ -0.45
TRPS1-208ENST00000519076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.2□□□□□ -0.46
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.2□□□□□ -0.46
TRPS1-208ENST00000519076 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TRPS1-208ENST00000519076 BICRAQ9NZM4 1560 aa12.17□□□□□ -0.46
TRPS1-208ENST00000519076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 BCL11AQ9H165 835 aa12.12□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC8Q09428 1581 aa12.11□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.1□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.09□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCA2P51531 1590 aa12.06□□□□□ -0.48
TRPS1-208ENST00000519076 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
TRPS1-208ENST00000519076 SOGA1O94964 1423 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-208ENST00000519076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 NCAPD3P42695 1498 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 EEA1Q15075 1411 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 CEP162Q5TB80 1403 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA3Q08378 1498 aa11.82□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.77□□□□□ -0.52
TRPS1-208ENST00000519076 SYNJ1O43426 1573 aa11.77□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 CLIP1P30622 1438 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 HMGXB3Q12766 1538 aa11.76□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 KIF27Q86VH2 1401 aa11.75□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 P3H3Q8IVL6 736 aa11.75□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 ITGAEP38570 1179 aa11.71□□□□□ -0.53
TRPS1-208ENST00000519076 CFTRP13569 1480 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-208ENST00000519076 CUX2O14529 1486 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-208ENST00000519076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-208ENST00000519076 NESP48681 1621 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 CUX1P39880 1505 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 TOP2BQ02880 1626 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 FBLN2P98095 1184 aa11.58□□□□□ -0.55
TRPS1-208ENST00000519076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.57□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.57□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.55□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 ARID3CA6NKF2 412 aa11.54□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 IGF1RP08069 1367 aa11.54□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 KIF21BO75037 1637 aa11.53□□□□□ -0.56
TRPS1-208ENST00000519076 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.51□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 PRXQ9BXM0 1461 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-208ENST00000519076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.49□□□□□ -0.57
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