Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO2Q9Y3B8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms