Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX12Q9UMY4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX12Q9UMY4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms