Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms