Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAPAQ9P0L0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms