Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIM2Q9NZV7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIM2Q9NZV7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms