Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT1Q9NXH9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms