Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LTBP3Q9NS15 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms