Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf50Q9HD87 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf50Q9HD87 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms