Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX22Q96L94 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms