Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMD3Q96D46 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms