Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCE1Q969G3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCE1Q969G3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms