Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGDCC4Q8TDY8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGDCC4Q8TDY8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms