Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms