Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCBE1Q6UXH8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms