Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms