Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SAMD5Q5TGI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms