Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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TNXAQ16473 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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