Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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