Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF5AQ12840 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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