Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP2P63027 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP2P63027 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms