Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF135P52742 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms