Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms