Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
J3KT08 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
J3KT08 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
J3KT08 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
J3KT08 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms