Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PGPEP1LA6NFU8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGPEP1LA6NFU8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms