Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
V9GYV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYV3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
V9GYV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
V9GYV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
V9GYV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
V9GYV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
V9GYV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYV3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYV3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYV3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
V9GYV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
V9GYV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
V9GYV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
V9GYV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
V9GYV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
V9GYV3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
V9GYV3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
V9GYV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
V9GYV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
V9GYV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
V9GYV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
V9GYV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
V9GYV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
V9GYV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
V9GYV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
V9GYV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
V9GYV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
V9GYV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
V9GYV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
V9GYV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
V9GYV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
V9GYV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
V9GYV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
V9GYV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
V9GYV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
V9GYV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms