Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AUP1Q9Y679 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AUP1Q9Y679 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AUP1Q9Y679 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AUP1Q9Y679 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AUP1Q9Y679 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms