Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAI2Q9Y5P3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAI2Q9Y5P3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAI2Q9Y5P3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAI2Q9Y5P3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms