Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G7

PCDHGA6, Protocadherin gamma-A6, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGA6Q9Y5G7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA6Q9Y5G7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA6Q9Y5G7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA6Q9Y5G7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA6Q9Y5G7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms