Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AFG3L2Q9Y4W6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AFG3L2Q9Y4W6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
AFG3L2Q9Y4W6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
AFG3L2Q9Y4W6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
AFG3L2Q9Y4W6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms