Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSUH2Q9Y2M2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSUH2Q9Y2M2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SSUH2Q9Y2M2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSUH2Q9Y2M2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms