Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PADI4Q9UM07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PADI4Q9UM07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PADI4Q9UM07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PADI4Q9UM07 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.1 ms