Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP50Q9UKX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP50Q9UKX7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP50Q9UKX7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP50Q9UKX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms