Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL4Q9UKA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL4Q9UKA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL4Q9UKA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXL4Q9UKA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXL4Q9UKA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXL4Q9UKA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXL4Q9UKA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXL4Q9UKA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXL4Q9UKA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms