Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCND3Q9UK17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCND3Q9UK17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND3Q9UK17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND3Q9UK17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms