Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBD1Q9UJT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBD1Q9UJT1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBD1Q9UJT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBD1Q9UJT1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBD1Q9UJT1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBD1Q9UJT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms