Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPIF1Q9UII2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATPIF1Q9UII2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATPIF1Q9UII2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATPIF1Q9UII2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms