Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LCMT1Q9UIC8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LCMT1Q9UIC8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LCMT1Q9UIC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LCMT1Q9UIC8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LCMT1Q9UIC8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCMT1Q9UIC8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms