Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MED13Q9UHV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED13Q9UHV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED13Q9UHV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED13Q9UHV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED13Q9UHV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED13Q9UHV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms