Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO40Q9UH90 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FBXO40Q9UH90 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO40Q9UH90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FBXO40Q9UH90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FBXO40Q9UH90 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO40Q9UH90 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms