Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJB4Q9UDY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAJB4Q9UDY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJB4Q9UDY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNAJB4Q9UDY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJB4Q9UDY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJB4Q9UDY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms