Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBG3

CRNN, Cornulin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNNQ9UBG3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRNNQ9UBG3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNNQ9UBG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRNNQ9UBG3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNNQ9UBG3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNNQ9UBG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRNNQ9UBG3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRNNQ9UBG3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms