Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCMF1Q9P0J7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCMF1Q9P0J7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCMF1Q9P0J7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms