Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF12Q9NZN5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ARHGEF12Q9NZN5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ARHGEF12Q9NZN5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ARHGEF12Q9NZN5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGEF12Q9NZN5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGEF12Q9NZN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms